基因石被毁，不料基因石能量逸出，飘散到地球各处，引发了异常现象：森林树木变得更茂密，湖泊海洋闪发着光，电力强化导致设备爆炸。由于基因源事故，武装战士变成变形机甲、生物进化为虫族、浩肯星人异化为变异战士，故事从变形机甲、机甲兽和变异战士三方之间的斗争展开。
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凯特、汉弗莱和他们的三只幼崽被迫搬迁巢穴后，他们发现了一只名叫艾米的友善迅猛龙。艾米在一次大型挖掘工程中被掩埋，却奇迹般地复活了。幼崽们和森林里的朋友们向艾米展示了新世界的奇妙之处，他们必须齐心协力，阻止挖掘者在为时已晚之前挖出霸王龙的危险。
一对年轻夫妇生活在2220年贫瘠、后世界末日的布达佩斯，为了食物和生活而奋斗。
蚂蚁战队为守护家园，与雷、仇两路人马展开圣兽力量的争夺，最后决战于炽火塔内。在圣兽感召下，蚂蚁战队逆转局势，并将敌人击退！所有人也得到圣兽力量的洗礼，心灵和实力都得到了重生，并携手向更高目标迈进。
改编自广山弘原作的《Fate/stay night》外传漫画《Fate/kaleid liner 魔法少女☆伊莉雅 3rei!!》第7卷内容。剧情作为电视动画《Fate/kaleid liner 魔法少女☆伊莉雅》的前传，“平行世界”中卫宫士郎和美游两兄妹的故事。“我想我可以说出来了。我与美游的……至今为止的故事”世界向着毁灭前进。能够阻止毁灭的步伐的，唯有身为“圣杯”的美游的牺牲而已。要选择世界，还是美游——。面对发起“世界的救济”的恩兹华斯所提出的这个问题，伊莉雅给出的答案是，“拯救双方”这种单纯的“任性”。战斗迎来暂时的休止，一行人暂时栖身于美游与士郎成长的家中。在众人团聚的途中，士郎开始讲述自己与美游的过去。曾经能够无差别地实现任何愿望的神稚儿美游。士郎将无家可归的她带回了自己与切嗣一同生活过的家里。在那之后过了5年。两人如同亲兄妹一般度过着平稳的生活。但是这样的日常却突然迎来了结束。造访美游老家的两人。在他们的面前，将美游当成“奇迹”地追求的朱利安出现了——。美游与士郎、恩兹华斯的因缘，在此揭晓。
《#Fate/kaleid liner# #魔法少女☆伊莉雅#》新作剧场版《Fate/kaleid liner 魔法少女☆伊莉雅 Licht 无名少女》将于2021年在日本上映！。
